Учитель младших классов является членом секты свидетелей иеговы

Свидетели Иеговы - организация признана сектой. Что такое секта? Читаем в словаре. Кстати, добавлю: с недавних пор эта секта запрещена на территории России решением Верховного суда.

Значит если учитель имеет свою веру, надо насторожиться? А если он православный христианин? Это не вызывает настороженности? А вдруг он будет втюхивать свою веру 8-ми летним мусульманам? Тоже надо насторожиться!

По возможности перевести в другой класс, другую школу...

Я бы тоже на месте мамы насторожилась.

А что происходит на уроках?
Если учитель не ведёт пропаганды, то претензий к ней никаких быть не может.
А если Вы попытаетесь начать "действовать", то это может быть расценено, как вмешательство в личную жизнь, что карается ст. 137 УК РФ. Нет нарушений на работе, выполняет все свои обязанности, не нарушает закон об образовании, то претензий к ней, как к работнику быть не может.